En cas d’intolérance, il convient de supprimer les aliments incriminés. On pourra ensuite pour certains essayer de les réintroduire un par un et avec une surveillance particulière des réactions que cela pourrait engendrer.

Deux méthodes sont utilisables :
 une approche empirique consistant à supprimer quelques aliment choisis à l’aveugle, et tester si les symptômes diminuent. Cette méthode est très laborieuse et repose sur la chance de sélectionner rapidement les aliments incriminés. Quand on sait que le test foodscan permet d’évaluer 113 aliments, cela donne une idée du temps nécessaire si l’on n’est pas particulièrement chanceux.
 un test préalable qui permet d’identifier directement les aliments incriminés. Ils sont alors supprimés de l’alimentation. On peut ensuite essayer d’en réintroduire certains un par un pour tester s’ils peuvent éventuellement être supportés par l’organisme.